Pärast II Maailmasõda liitusid Tartus tegutsevad baptistikogudused ainsa allesjäänud baptistipalvelaga: Kolgata kogudusega, mille palvela oli avatud 1931.aastal.

2013. aastal kolis kogudus vanast Karlova linnaosas paiknevast palvemajast ruumipuuduse tõttu kesklinna piiril asuvasse kaasaegsesse 1995.a valminud kirikuhoonesse. Avajumalateenistus uues Veski tänava hoones toimus 10. nov 2013 koos Kolgata koguduse 112. aastapäeva tähistamisega.

Kogudus kuulub Eesti Evangeeliumi Kristlaste ja Baptistide Koguduste Liitu. Eestikeelsed jumalateenistused toimuvad pühapäeviti kell 11, venekeelsed kell 13.